影片《三目封神传》是一部奇幻喜剧片，围绕二郎神杨戬的转世传说展开。根据古老神话，二郎神为替母赎罪，需以凡人之躯完成千次除妖壮举，方能再度封神。因此，他每次转世皆以丧失神力的婴儿形态降临人间，直至成年方可觉醒。

人间世代守护此秘密的“护神族”神婆奂灵，机缘下捡到了额生三目的婴儿，坚信其为二郎神转世，并为之取名杨戬，悉心抚养二十年。影片故事便始于杨戬成年之际，邪恶的妖王混沌感知到封印松动，蠢蠢欲动，企图颠覆人间。

此时，尚未觉醒全部神力的杨戬，与护神族的伙伴们，不得不踏上对抗混沌、守护苍生的征程。这一路上乌龙百出，笑料不断，他们将面对各种稀奇古怪的小妖与挑战，在充满欢闹的冒险中，杨戬逐渐接近自己真正的使命与力量，演绎了一段关于成长、责任与爆笑降妖的奇幻故事。