《快乐酷宝2》延续了第一季的世界观，故事围绕地球附近的异空间“酷宝王国”展开。这个奇妙的国度居住着以人类情绪波动产生的能量为食的酷宝。情感核能分为两种：由开心、欢乐等正面情绪产生的七彩元动能，以及由悲伤、痛苦等负面情绪汇聚的黑色邪动能。

本季的核心矛盾聚焦于企图收集黑色邪动能以统治世界的女魔头阿酷波斯。她利用人类的负面情绪壮大自己的力量，给两个世界都带来了危机。为了对抗邪恶，地球少年乐乐和他的伙伴们再次挺身而出，与善良的酷宝们结成牢固的同盟。

剧情中，主角们需要穿梭于地球与酷宝王国之间，一方面在日常生活中引导人们产生更多正面情绪，收集七彩元动能；另一方面则在奇幻的异空间战场与阿酷波斯及其手下展开激烈较量。故事融合了友情、勇气与守护的主题，通过一系列冒险，展现了正邪对抗中成长与团结的力量。