在《奇门密探》这部古装喜剧片中，江湖上赫赫有名的奇门派与五毒派，因“皇家龙种花落谁家”这一宫廷秘事被卷入纷争。双方为了各自的目的，在宫廷内外使尽浑身解数，斗智斗勇，闹出连串令人捧腹的笑话。

然而，在一系列误打误撞的事件中，两派弟子意外发现了一个更深层的阴谋：当今皇叔正暗中布局，企图让皇帝（陈浩民 饰）断绝子嗣，以便在其驾崩后篡夺皇位。皇叔的阴谋甚至渗透到了皇后（胡然 饰）身边，潜伏着来自五毒派的弟子作为内应。

原本互为对手的奇门派与五毒派，在面对共同的巨大威胁时，不得不暂时放下成见，联手应对。他们运用各自的奇门术法与用毒技巧，与狡猾的皇叔及其党羽展开了一场充满智慧较量与滑稽动作的对决。影片将江湖恩怨、宫廷权谋与无厘头喜剧巧妙结合，最终呈现了一场正义战胜邪恶、欢笑不断的宫廷保卫战。