影片《阴阳无敌功》以明代嘉靖年间东南沿海的抗倭斗争为历史背景，讲述了一段武林侠士抵御外侮的传奇故事。日本海盗首领与福建、浙江沿海的土豪劣绅及旁门左道邪派相互勾结，势力猖獗，他们攻占了重要的据点白云庄，并以此为基地，四处烧杀抢掠，致使沿海百姓生活在水深火热之中。

青年武士樊振东，身怀绝技，心怀家国，目睹倭寇暴行与同胞苦难，毅然决然地站了出来。他振臂一呼，组织起当地的民众和有志之士，组建起一支抗倭的队伍。面对装备精良、手段残忍且与邪术结合的敌人，樊振东凭借过人的武勇与智慧，顽强抵抗。

樊振东的抗争事迹很快传遍江湖，武林中的正派人士深感义之所在。各大门派摒弃前嫌，同仇敌忾，纷纷派出高手前来支援，与樊振东的队伍汇合。一场汇聚了中原武林正义力量，对抗外来侵略者及其帮凶的惨烈对决，在白云庄内外激烈展开。影片通过这场正邪大战，展现了中华儿女不畏强暴、团结御侮的民族精神与侠义情怀。